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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

江西检察机关依法对陈家东涉嫌受贿、贪污、滥用职权案提起公诉******

　　福建省厦门市人大常委会原主任陈家东涉嫌受贿、贪污、滥用职权一案，由国家监察委员会调查终结，经最高人民检察院指定，由江西省南昌市人民检察院审查起诉。近日，南昌市人民检察院已向南昌市中级人民法院提起公诉。

　　检察机关在审查起诉阶段依法告知了被告人陈家东享有的诉讼权利，并讯问了被告人，听取了辩护人的意见。检察机关起诉指控：被告人陈家东利用担任西藏自治区林芝地委副书记、林芝地区行政公署常务副专员，福建省宁德市委副书记、宁德市人民政府市长，福建省林业厅党组书记、厅长，福建省漳州市委书记，福建省厦门市人大常委会主任等职务上的便利，为他人谋取利益，以及利用本人职权或者地位形成的便利条件，通过其他国家工作人员职务上的行为，为他人谋取不正当利益，非法收受他人财物，数额特别巨大；身为国家工作人员，利用职务上的便利，与他人共同侵吞国有财产，数额特别巨大；身为国家机关工作人员，徇私舞弊、滥用职权，致使公共财产遭受重大损失，情节特别严重，依法应当以受贿罪、贪污罪、滥用职权罪追究其刑事责任。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）